Genes para resiliência à covid-19: identificação de marcadores de DNA correspondentes à resistência ao coronavírus esuscetibilidade

Analise seu DNA em casa: Genet Coronavírus (CoVs) (ordem Nidovirales, família Coronaviridae, subfamília Coronavirinae) são responsáveis ​​para surtos de doenças respiratórias em muitos espécies de vertebrados. Eles são uma grande família de solteiros-vírus envelopados com RNA encalhado (+ssRNA) que podem ser isolado em diferentes espécies animais. Eles têmtamanhos de genoma variando entre 26 a 32 kilobases (kb) de comprimento, sendo os maiores genomas para RNAvírus (consequentemente aumentando a eficácia de máscaras faciais). COVID-19 também conhecido como agudo grave síndrome respiratória coronavírus 2 (SARS-CoV-2), ou "romance coronavírus 2019" é um novo vírus e estamos apenas começando a entenderresistência e suscetibilidade em humanos. Marcadores ic correspondentes ao COVID-19 Resiliência.

COVID-19 é semelhante à síndrome respiratória aguda grave (SARS) no sentido de que ambos os vírus infectam seus hospedeiros humanos através do mesmo receptor, o receptor da enzima conversora de angiotensina 2 (ACE2 receptor), e causam características clínicas e patológicas semelhantes. Interessantemente, a proteína espícula responsável pela ligação ao receptor é altamente semelhante entre 2019-nCoV e SARS-CoV, resultado de uma significativa seleção para o mesmo receptor (Wu., 2020). A pesquisa sobre como nosso corpo se defende da SARS pode revelar como nosso corpo pode se defender contra o covid-19. Vários estudos de associação genômica ampla (GWAS) recentes forneceram uma compreensão muito mais profunda das variações genéticas que podem ajudar a explicar por que algumas pessoas são praticamente imunes ao COVID-19 e, para outras, o vírus é ameaçador de vida ou até fatal.

Neste post, fornecemos uma revisão da literatura revisada por pares e apresentamos informações sobre os genes candidatos para resistência ao SARS-CoV. Se você fez um teste de DNA em casa, como os disponíveis em 23andMe, Ancestry DNA, Dante labs, pode avaliar seus dados de DNA brutos e ver como a sua sequência de DNA se compara com os resultados da pesquisa.

Como analisar seu DNA para resistência ou suscetibilidade ao coronavírus?

Passo 1) Baixe seu arquivo de DNA autossômico bruto e salve-o em um local seguro e seguro

Para analisar seus dados de DNA, comece baixando seu DNA autossômico bruto e salvando-o em um local seguro. Aqui estão as instruções para baixar seu arquivo de DNA bruto de: 23andMe, Ancestry DNA, Family Tree DNA, Dante Labs, My Heritage, Genes For Good, Vitagene, and Living DNA.

Etapa 2) Analise seu arquivo de DNA bruto

Pesquise seus dados de DNA bruto usando um editor de texto como "text wrangler" ou "notepad" usando a função "encontrar" ou usando o prompt de comando.

Abra seu arquivo de DNA bruto e você notará os cabeçalhos de SNP ID (rs# ou i#) únicos, cromossomo, posição e genótipo. Os formatos diferem ligeiramente entre cada empresa de teste de DNA direto para o consumidor.

Para avaliar o seu risco de má recuperação da COVID-19, procure por esses marcadores de DNA descritos abaixo:

Vários Estudos de Associação Genômica (GWAS) foram publicados recentemente que descrevem loci associados à falha respiratória em pacientes infectados com SARS-CoV-2 e três estudos identificaram marcadores SNP no mesmo segmento genômico de ~50 kb que é herdado dos Neandertais. (Ellinghaus D et al., 2020, Zeberg & Pääbo, and Blokland et al., 2020). Além disso, estudos de GWAS também identificaram um número de outros marcadores de DNA associados ao COVID-19, e cada um deles é apresentado na tabela abaixo.

Além disso, outros marcadores de DNA abordados neste post incluem o rs4804803, que foi associado à SARS, e aqueles posicionados no receptor da enzima conversora de angiotensina-2 (ACE2), que foi comprovado ser o mesmo receptor para o coronavírus respiratório humano NL63, SARS-coronavírus (SARS-CoV) e o novo coronavírus 2019-nCoV / SARS-CoV (Li et al., 2017; Lu et al., 2019). Uma vez que a proteína espícula do coronavírus evoluiu para se adaptar ao receptor ACE2, é provável que indivíduos com variações que alteram a sequência da proteína resultem em um certo grau de resistência à covid-19. Abaixo estão os SNPs não-sinônimos do transcripto ACE2 NM_021804.2 e, em particular, os SNPs que causam mudanças significativas, como o rs199951323, que resulta em um códon de parada prematuro.