針對 COVID-19 韌性的基因：識別與冠狀病毒抵抗力和易感性相關的 DNA 標記

冠狀病毒（CoVs）（目 Nidovirales，科 Coronaviridae，亞科 Coronavirinae）是許多脊椎動物物種呼吸道疾病疫情的元兇。它們是一大類單鏈RNA包膜病毒（+ssRNA），可以在不同的動物物種中被分離出來。它們的基因組大小介於26到32千鹼基對（kb）之間，是RNA病毒中基因組最大的（因此提高了口罩的有效性）。COVID-19，也被稱為嚴重急性呼吸綜合症冠狀病毒2型（SARS-CoV-2），或“2019新冠病毒”，是一種新病毒，我們才剛開始理解人類的抗性和易感性。

COVID-19 與嚴重急性呼吸綜合症 (SARS) 有相似之處，因為這兩種病毒都是通過相同的受體——血管緊張素轉換酶 2 (ACE2 受體) 來感染人類宿主，並引起類似的臨床和病理特徵。有趣的是，負責受體結合的刺突蛋白在 2019-nCoV 和 SARS-CoV 之間高度相似，這是因為對相同受體的顯著選擇所致 (Wu., 2020)。對我們的身體如何抵抗 SARS 的研究可能揭示我們的身體如何抵抗 COVID-19。

最近幾項全基因組關聯研究 (GWAS) 提供了更深入的見解，幫助解釋為什麼有些人幾乎不受 COVID-19 影響，而對其他人來說，這種病毒則是生命威脅甚至致命的。

在這篇文章中，我們提供了經過同行評審的文獻回顧，並介紹了與SARS-CoV抗性相關的候選基因資訊。如果您曾經進行過像23andMe、Ancestry DNA或Dante labs等公司的居家DNA測試，您可以評估您的原始DNA數據，並查看您的DNA序列與研究結果的比較。

如何分析您的DNA以抵抗或易感于冠状病毒？

步驟 1) 下載您的原始常染色體 DNA 檔案並將其保存到安全的位置

要分析您的 DNA 數據，首先下載您的原始常染色體 DNA，並將其保存到安全的位置。 以下是從下載您的原始 DNA 檔案的說明：

步骤 2) 分析您的原始 DNA 文件

使用文本編輯器（如 "text wrangler" 或 "notepad"）透過 "查找" 功能或命令行搜索您的原始 DNA 數據。

打開您的原始 DNA 文件，您會注意到獨特的 SNP ID (rs# 或 i#)、染色體、位置和基因型的標題。不同的消費者 DNA 測試公司之間的格式略有不同。

要評估您從 COVID-19 中恢復不良的風險，請查看以下描述的 DNA 標記：

最近發表了幾項全基因組關聯研究（GWAS），描述了與 SARS-CoV-2 感染患者的呼吸衰竭相關的位點，並且有三項研究在同一 ~50 kb 的基因組區段中識別了 SNP 標記，該區段是從尼安德特人那裡繼承的。

此外，本文提到的其他DNA標記包括rs4804803，該標記與SARS有關，還有位於血管緊張素轉換酶-2（ACE2）受體的標記，這被證明是人類呼吸道冠狀病毒NL63、SARS冠狀病毒（SARS-CoV）以及2019新型冠狀病毒2019-nCoV/SARS-CoV的相同受體（Li et al., 2017; Lu et al., 2019）。由於冠狀病毒的刺突蛋白已進化以匹配ACE2受體，因此擁有改變該蛋白質序列的變異的個體，可能會對COVID-19產生一定程度的抵抗力。以下是來自ACE2轉錄本NM_021804.2的非同義單核苷酸多態性（SNP），特別值得注意的是像rs199951323這樣會導致重大變化的SNP，該變異導致提前終止密碼子。